Самое первое дерево было посажено министром иностранных дел Японии Синтаро Абэ еще в 1986 году. В настоящее время в саду насчитывается более 250 деревьев, из которых ежегодно зацветает около 40. В Японии наиболее широко распространена сакура Сомэй Ёсино, известная своими чистыми белыми цветками. Сакура, растущая в московском Японском саду, относится к виду Эдзояма (или Prunus Sargentii – вишня Сарджента). Особенность этого вида сакуры в том, что розовые цветки на ней появляются одновременно с первыми листочками. Эта сакура хорошо адаптируется к суровым климатическим условиям России. Накануне начала цветения, 30 апреля сад посетил премьер-министр Японии Синдзо Абэ с супругой в рамках своего официального визита в Москву, и посадил саженец сакуры, черенки, которых были взяты от первого дерева сакуры, посаженной в 1986 году его отцом Синтаро Абэ, занимавшего тогда пост министра иностранных дел Японии.
В Японии полагают, что тому, кто не воспринимает красоту природы, нельзя доверять ни в чем, поскольку у него «сердце из камня». С каждым временем года у японцев были связаны определенные обычаи и обряды. Особую известность получили ханами (дословный перевод - "любование цветами"). Традиция любования цветами зародилась на японских островах еще в третьем веке нашей эры при императорском дворе и изначально была уделом аристократов. Это один из древнейших обрядов японцев. Сейчас ханами - поистине народный праздник. Именно в период цветения жители Японии массово выезжают на пикники с родными, друзьями и коллегами, чтобы успеть насладиться традиционными весенними сладостями и общением друг с другом в тени бело-розовых деревьев. Цветение сакуры очень кратковременно, и это явление символизирует для японцев скоротечность всего в этом мире. Бело-розовое чудо длится всего несколько дней, а иногда лишь несколько часов. Сакура в Ботаническом садуцветет менее недели. Пик цветения может наступить уже через три-четыре дня после того, как распустились первые цветки. На сайте посольства Японии в Москве опубликованДневник цветения сакуры, в котором диппредставительство сообщает об этапах подготовки сада и цветения.
В подтверждение слов о красоте цветения - несколько примеров японской позии,описывающих и воспевающих моменты цветения:
Один за другимОпадают лепестки махровой сакуры,Порхая на ветру.Масаока СикиВ пору цветеньяВишни сродни облакам —Не потому лиСтала просторней душа,Словно весеннее небо…Камо МабутиВешним днём,Когда безмятежно лучитсяИзвечный свет,Вишни в сердечной тревогеСвои лепестки роняют.Ки-но ТомонориО, если б на светеВовек не бывало вас, Цветущие вишни! Наверно, тогда бы весноюУтешилось сердце моё.Аривара НарихираОт людских голосовПугливо вздрагивают по вечерамКрасавицы вишни.Кобаяси Исса